Базовое экспериментальное судно данной экспедиции планируется воссоздать по образу и с учётом технологических особенностей древних северных судов. Закладка корабля состоялась в марте 2006 года на уникальном озере Горного Алтая Телецкое. Архитектура и интерьеры корабля передадут дух Сибири времен Ермака. Материалом для строительства деревянного парусника «Атаман Ермак» служит алтайская сосна и сибирский кедр. Струг имеет длину 17 м и ширину 4,70 м.